Sep 26, 2008

Rta和MN

First of all, I want to clarify several disputing issues:
1. Is Rta functional in the cytoplasm?
Maybe, but most of the time Rta is working hard in the nucleus.表現量過多,過快,或是一邊進核一邊在胞質內"到此一遊留點紀念"的功能不是今天討論範圍.同理RtaNLSm在我心目中是一個細胞質蛋白,它的主要活性與核內的Rta應是截然不同的.

2. Does over-expression of Rta lead to MN formation in EBV-ve cells?是的,在楚穎論文裡,所算的p值都是許多次實驗重複驗證而成.據聞旻潔加做的synchronize細胞也可觀察到許多multinucleated, binucleated, and mis-segregated cells.

3. Does Rta-mediated MN formation contribute to NPC tumorigenesis?傾向不是.因為在有病毒genome存在下,Rta和其所活化的病毒蛋白會造成細胞停止生長或是凋亡.也就是說 cell cycle還走不到anaphase可能就死了(這個議題應在等我們有充份能力調控Rta在病毒感染細胞中的量時,再來探討)

基於上述三個成見,我想跟大家討論下面幾個問題:

1. Rta versus G2/M: 歆蘭,勝彥,楚穎以及現在旻潔都提到Rta對M phase的加速離開有貢獻.但是我這幾天仔細讀楚穎論文中圖七(B)之flow data,感覺上是有Rta的那一組停在G2/M較多時間(release後8,10h 比較)或是花較多時間進入G2/M(solvent組花6h達78%,Rta組花8h達79%);圖九(B)中有Rta的細胞在0點時, CCNB/CDK1/AuroraB等M期蛋白均較solvent control組少. Together, it seems to me that cells expressing Rta take longer to prepare for G2/M progression.

2. Rta versus AKT/ERK: Again, from楚穎論文圖七,圖八有Rta的細胞ERK1/2活性是有增加,而且聽說勝彥也有證據說明AKT也會on.所以Rta和mitogenic這條pathway是有影響作用的.但是影響的機致是什麼呢?因為第一段話的第一個成見,所以我比較傾向的推測是(1)會不會ERK1/2在某個時間應是被shut-down的(如圖七(B)solvent control r6, r8),但是因為有Rta時這個checkpoint的到達非常不容易,因此大多數看到的western blot analysis ERK1/2都是on的.(2)會不會Rta直接down-regulates某個phosphatase的表現(在我們的293TetER中 CDK4/CDK6/CCND1都是顯著被Rta down-regulation)
謅不出來了.提供二篇好文章,大家來腦力激盪一下!有想法盡量po上來,每個人貢獻一點積少定能成多! 下回見. ERK與cell cycle; PI3K/Akt與cell cycle.This one is also good!

Steve Jobs 好樣的

又到週末了,送大家兩篇好文章:(1)GUI的源頭 (2)尋夢與永保謙虛.祝大家有個愉快的週末!

Sep 25, 2008

大概會用吧 再囉唆一下

看到新的回應時,按一下該筆留言最下面的時間和作者(e.g. 2008-09-25-SFL),便可連結到原先發文的原文及所有回應之網頁. 讀完後按一下"首頁"(在最下方中間處)即可回家.另外在網頁最左上方有一個可以search本網誌的搜尋處,善用之可以快速找到你想要的舊資料.是word-search喔,所以只要是content中有的都行.試試"砂石車", "Rta",看看可以找出什麼. 好厲害的Google蠕形動物啊!

Sep 22, 2008

金車回收機制

有人要辦理金車三合一咖啡/奶茶退貨者.這裡有專線電話.讓我們向這群有社會道德良心的業者拍拍手!另外,國內生產的牛奶是Okay的,還有三聚氰胺讓蛋白質濃度測出偏高的原理在這裡.

Sep 18, 2008

一日遊報告&大家要去吃安平名產

我和另外四位老師7:45搭九人座小巴出發,吃了一個蘋果二片土司,8:15至竹北THSR,搭上自由席全滿只好加85元升等的441號8:45南下列車,9:49抵台南.出口處又碰到三位老師,一行八人搭上10:05爆滿且有許多人站著還上快速道路,最後把坐我旁邊小弟弟弄得暈頭轉向吐了出來又被阿公責備(弟弟)的接駁公車.10:45抵達統一大樓.11:00開會,12:15吃午餐.13:10~14:20閒聊閒逛.14:30解散.是你,會甘願就這樣回去嗎?? of course not. 於是我和另外二位老師壓迫一位地陪搭小黃到安平附近買了全世界第二好吃的武廟碗粿,永泰興蜜餞,東東蝦餅,喝了一杯兩角銀冬瓜茶,聽運匠阿伯說了一個神奇卻也令人心疼的老師受詐騙集團欺負的故事.這樣一去一返16:10又坐回駛在長榮路上往南徐徐而行的接駁公車上.16:48抵台南THSR,一陣緊湊衝刺之後(全天最刺激處),16:53坐在仍有空位的11號自由席車廂(If you are still reading,給我拍拍手).嘉義站上來了一位威儀極好的僧人,內心一陣清涼...台中站上來的人稍多,開始有人要用站的.18:02扺達高挑雄偉的竹北站,又看到三位出家人,提醒我該念念佛號了,整日心猿意馬地好浪費精力啊.於是在站內候車處出閉目養神一下,18:28等齊了沒趕上同一班車的另一位老師(我沒有被怨,因為..他人很好..嘿嘿),19:00返抵院區.

結論有三:
1)CL的阿桑級招待就是不一樣,我覺得竹南比較像CA的家耶
2)全台灣南北通車的人真的很多,THSR若有股票上市,可以考慮投資
3)台南重要路段紅燈太多,而且應該synchronize一下
提議有一:品嚐完給點意見. 我們把SOP寫出來,下次就可請南部同仁先買好,或宅配時達最佳效果.

Sep 16, 2008

大人不在,好好顧家&淑真來函

想到什麼可以由台南帶回來品嚐的請留言/簡訊在SFL手機中.真的很想去買那全天下最好吃的碗糕回來,不過據說不是在台南市(憾).是早上就開完會了,所以晚餐前會到家吧. 另外淑真來函喔,竟然鼓吹我去日本開會.說她要入學考了,最怕的是英文這一科..有誰知道她的email嗎,想去跟她打氣一下.謝謝!

歡迎新作者

哇哇哇,什麼時候冒出這麼Kawai的小東西...歡迎你!

Sep 12, 2008

我開學啦~

dear all:

喔 不好意思 讓大家擔心了

我下禮拜又要開學啦 (泣)......
所以禮拜一白天不會出現囉~
會持續到一月左右

阿~ 大家如果有有趣的 適合報告的paper(limit Sep. 2007~Sep. 2008)
請大家告訴我啦^O^~
拜託了^^~
謝謝喔

p.s 請大家出門在外要小心喔 離砂石車遠遠的喔~


YJC

天生好手!


我們是文柚最佳代言四人組



四人戴上柚子皮帽
四顆小柚子也一起戴柚子皮帽 Cute~

Sep 10, 2008

那麼,剝柚子比賽好玩嗎?贏了嗎?

Who is the weakest link? 敘述一下吧,為2008年的中秋節留下一點回憶!

陳老師要的Paper

這是今早許老師要我PNT一份給陳老師的paper. 留檔備用.

有請Ingrid或CCL幫忙校正

Dear Ingrid /CCL,
可否抽點空幫忙校正這一段,就是進入各個公司,輸入編號,看看叫出來的東西和我們寫的是否一致. 下次你們的paper會換成讓小蓮及其他人幫忙校對.謝謝!

Sep 9, 2008

今天的Lab Meeting

我們今天就來試試看新format,
下午到R1-2027討論的人是:
  • ingrid,一點至一點半
  • 小蓮,一點半至二點
大meeting上小丸子和小嬿各15分鐘

Sep 8, 2008

最近LMP1 papers (匆匆一瞥, 有錯請指正)

剛好看完, 分享一下~

(1) Tsuji et al (2008)
Induction of Receptor for Advanced Glycation End Products (RAGE) by EBV LMP1 and Its Correlation with Angiogenesis and Cervical Lymph Node Metastasis in Nasopharyngeal Carcinoma.
Clin Cancer Res. 14: 5368-75.

--> 阿本仔Furukawa等人新作, 先前研究發現LMP1對Cervical Lymph Node Metastasis與Angiogenesis有所貢獻, 而RAGE這玩意屬immunoglobulin superfamily一員且其overexpression與Metastasis及Angiogenesis相關, 阿本仔examined了42個NPC檢體, 證明了LMP1與RAGE相關, 且LMP1可能透過NFkB路徑活化RAGE, 進而促使NPC之Metastasis跟Angiogenesis ~


(2) Shair et al (2008)
EBV LMP1 effects on plakoglobin, cell growth, and migration.
Cancer Res. 68: 6997-7005.

--> Nancy 等人新作, 沒有tissue與老鼠的研究, 僅靠C666-1之stable clone就上Cancer Res喔!!!不愧是Nancy阿~~~ 此paper發現那些大量表現LMP1的C666-1細胞之growth與migration都比較強喔! 然後PI3K與NFkB路徑對此現象都很重要, LMP1也會抑制plakoglobin(又叫gamma-catenin, 與E-cad結合的東西), 對migration很重要哩 !

Sep 6, 2008

EBV 2008 Symposium (更新)

曾益新廣東GD1 strain,ERTA有三個a.a. mutation,分別是P572(73%), Q489K(63%) and A377K);則有高達個分別是

9/2/2008 SFL wrote:

abstract submission deadline 是九月十五. 首頁在這裡.

曾毅是78歲的中國鼻咽癌開山始祖, 還有一篇 (NPC Vaccine, Published on Science news-August-29-2008)。

防毒軟體重新洗牌

小紅傘真的快罩不住了嗎?請給點建議吧-高手們!

Sep 4, 2008

歡迎phil

這個人好有品味的樣子 興趣真是廣泛啊 (熱烈掌聲歡迎中)

Sep 3, 2008

當踢館者出現時 我們要冷靜

其實,不太想講太多,但當一個迂迥6次的下游物件(如LMP1)號稱是王道時
Reactivation就聞到PK者出現了 不得不捍衛一下
請問是誰,會讓LMP1大量表現的?是reactivation
是誰,會讓lytic cycle(=GI=王道中的王道)有效產生的?是reactivation
是誰,讓病毒獲得自由,不用一輩子卑微地活在同一個細胞中?也是reactivation
......(冷靜中)......
這一篇和這一篇本是準備給一個失去部份自由的whiterailway君看的
如果LMP1真能和老化聯在一起 那才真的是王道!
......(再冷一次)......
讓我們歡迎 “LMP1才是王道“ (拍掌聲)

向PWW的好記性致敬

Dear PWW,
太強了! 竟然還記得這些clone.
we salute you!
先前誤把K的Zp (labeled as pZp#7)當E-Zp的 wild type
而標示pZp((RZluc(ΔZ))這一管當做E-Zp的mutant在做
所以一直沒有activity. 謝謝妳的"記憶力"
那妳還記得pZp((RZluc(ΔZ)到底是什麼呢?

-by正港老灰阿啦

Sep 1, 2008

我是老灰阿~

Dear老闆大人
我發現我剛剛忘記跟你說謝謝了
謝謝你^^~

真的會在9月1日貼出此文嗎

今天是2008年最後四個月的第一天
Reactivation要好好把握時間
我們今年一定要有Paper!!