Database of Gene transcription in mouse embryo
http://www.eurexpress.org/ee/intro.html
上面的資料庫是利用In situ hybirdization
來偵測特定基因/ microRNA 在老鼠胚胎中的表現強度與位置
可以用來尋找有興趣的基因 在老鼠發育的過程中是否有扮演角色
May 30, 2012
May 29, 2012
May 26, 2012
May 25, 2012
Pyro-sequencer is on my lab now!
Pyrosequencing machine 現在正在我們實驗室，廠商預計會放一個月，Allen會來用，我想應該還會有空檔，有需要的同仁(SFL and YWC lab)，也歡迎你們來用(千萬不要宣揚!)
May 24, 2012
Review Papers for MMPs
Dear all:
Here are three MMPs reviews talking about MMPs structures,categories, and their functions in cancer. Enjoy it~
Can
Here are three MMPs reviews talking about MMPs structures,categories, and their functions in cancer. Enjoy it~
Can
about Q-PCR system
hello 各位伙伴們,在這跟大家說一聲抱歉,因為最近有一批 patient's samples要跑,所以我預約掉大部分Q-PCR的時間,依目前預約情形此狀況會維持到六月中,這段時間若各位有急須使用,須要橋一下時間,請跟我說一聲,造成大家的不便,實在非常抱歉!!
願各位實驗順利,常保好心情 ^^ Tau
願各位實驗順利,常保好心情 ^^ Tau
May 23, 2012
Hi~大家好~我是罐頭~
Dear all:
Here is my journal club pdf file yesterday. If there is any problem (u can't see this file in the link), plz tell me. thanks~ BTW, u can call me "罐頭" or "Can" in this blogger.
Can
Here is my journal club pdf file yesterday. If there is any problem (u can't see this file in the link), plz tell me. thanks~ BTW, u can call me "罐頭" or "Can" in this blogger.
Can
May 18, 2012
[小夏日文教室] 出張&出張所
其實"出張"老師上課有補充教學過，就是"出差"的意思。我一時忘記了，對不起老師......而"出張所"我就完全沒概念了，以下是網路查詢的資料。
"出張所" 意旨某某轄區的行政機關，「出張」的日語即出差的意思。換句話說，出張所用現代的詞語來說明，有點類似離總公司遠處的出差辦公機關。因此日治時期有稅務出張所、專賣局出張所、郵便出張所等。 (台灣大百科全書)
因此，出張所指的是某轄區的行政機關，也就是說，出張所，有點像是出差辦公的分辦公室！報告完畢!!! 謝謝曉茹的報告，真是充滿回憶的旅程。
最後謝謝大夏的餐點，就捧派 唷，好飽好飽唷~~~~~~
"出張所" 意旨某某轄區的行政機關，「出張」的日語即出差的意思。換句話說，出張所用現代的詞語來說明，有點類似離總公司遠處的出差辦公機關。因此日治時期有稅務出張所、專賣局出張所、郵便出張所等。 (台灣大百科全書)
因此，出張所指的是某轄區的行政機關，也就是說，出張所，有點像是出差辦公的分辦公室！報告完畢!!! 謝謝曉茹的報告，真是充滿回憶的旅程。
最後謝謝大夏的餐點，就捧派 唷，好飽好飽唷~~~~~~
May 15, 2012
Dear all:
I found a good article and shared it to you!
(人類是一種習慣性的動物，常會用相同的思考模式和方法去面對問題。也就是說，當你在一個領域越久，你就越難跳脫思考的框架!!)
:)
I found a good article and shared it to you!
Cooking Up Creative Solutions (More collaborators and more data are the key ingredients)
"Humans are creatures of habit and tend to think of the same ideas and approaches over and over again. When you’ve been in a field for a while, it is harder to think your way out of the box."(人類是一種習慣性的動物，常會用相同的思考模式和方法去面對問題。也就是說，當你在一個領域越久，你就越難跳脫思考的框架!!)
:)
May 14, 2012
Party Time is coming soon........
親愛的工作夥伴們:
你累了嗎? 你煩了嗎? 你工作低潮嗎?
為了感謝大家的努力及對實驗的付出，我們將於5/18(五) 中午11:30分於R2-1042舉行一個簡單的 party，希望大家能 "暫時" 放下手邊的工作，我們就吃吃喝喝東聊西聊放鬆 "一下"，雖不是滿漢大餐，但希望夥伴們能盡情享受，這次不用你們 "跑腿"啦，就讓大夏我幫各位服務，將餐點準備好，你們------------------只要自備餐具蒞臨現場就行啦!!
ps:若有任何意見，請撥打客服專線31707，將由專人(就是大夏我啦)為您服務! 請勿申訴!!
你累了嗎? 你煩了嗎? 你工作低潮嗎?
為了感謝大家的努力及對實驗的付出，我們將於5/18(五) 中午11:30分於R2-1042舉行一個簡單的 party，希望大家能 "暫時" 放下手邊的工作，我們就吃吃喝喝東聊西聊放鬆 "一下"，雖不是滿漢大餐，但希望夥伴們能盡情享受，這次不用你們 "跑腿"啦，就讓大夏我幫各位服務，將餐點準備好，你們------------------只要自備餐具蒞臨現場就行啦!!
ps:若有任何意見，請撥打客服專線31707，將由專人(就是大夏我啦)為您服務! 請勿申訴!!
May 11, 2012
分享一篇好文章–>讓工作更有效率
全文在這裡。
把Copywriter改成paper writing, paper reading等等你每天要做的事情皆合適。
Four points:
1.Get More Sleep (7–8 hr/Day)
2.Reduce Distractions (讓我想到在學校裡，一堂課40~50分鐘不讓你做雜事是有道理的)
3.Eat the Frog (存疑)
4.Set Mini-Deadlines (學習規劃最重要，避免眼高手低是可以訓練出來的)
要提高工作效率，SFL認為睡飽飽很重要，DAVID則覺得吃飽飽也很重要，因此第3點建議很好，青蛙用來煮湯或三杯都很棒，這個作者不錯，知道青蛙可以用來補精力! :) (素食者不宜)
ps: "eat thr frog" 是指將比較困難或複雜的工作排在一天的開始，優先執行，如果完成了，不僅成就感大，其他較簡單的工作任務，就更容易完成了，因為最困難的不是完成了嗎? ~~共勉之
把Copywriter改成paper writing, paper reading等等你每天要做的事情皆合適。
Four points:
1.Get More Sleep (7–8 hr/Day)
2.Reduce Distractions (讓我想到在學校裡，一堂課40~50分鐘不讓你做雜事是有道理的)
3.Eat the Frog (存疑)
4.Set Mini-Deadlines (學習規劃最重要，避免眼高手低是可以訓練出來的)
要提高工作效率，SFL認為睡飽飽很重要，DAVID則覺得吃飽飽也很重要，因此第3點建議很好，青蛙用來煮湯或三杯都很棒，這個作者不錯，知道青蛙可以用來補精力! :) (素食者不宜)
ps: "eat thr frog" 是指將比較困難或複雜的工作排在一天的開始，優先執行，如果完成了，不僅成就感大，其他較簡單的工作任務，就更容易完成了，因為最困難的不是完成了嗎? ~~共勉之
- (謝謝DAVID桑的翻譯與重點提示!)
May 10, 2012
厲害就是厲害-松濤又考上博士班了!! 怎麼辦呢!
0610 生命科學院結構生物學程
正取共： 5 名 （依准考證號排列）
一般生 共 5 人
06100001 李翊榮 06100002 林台文 06100003 周松濤 06100004 蔡彥俊
06100006 林怡亭
08B 生科院醫學生物科技學程
正取共： 6 名 （依准考證排列）
一般生 共 6 人
06080002 翁紹娙 06080004 陳瑜帆 06080005 鄒岳良 06080009 周松濤06080011 王義翔 06080013 劉秉鑫
正取共： 5 名 （依准考證號排列）
一般生 共 5 人
06100001 李翊榮 06100002 林台文 06100003 周松濤 06100004 蔡彥俊
06100006 林怡亭
08B 生科院醫學生物科技學程
正取共： 6 名 （依准考證排列）
一般生 共 6 人
06080002 翁紹娙 06080004 陳瑜帆 06080005 鄒岳良 06080009 周松濤06080011 王義翔 06080013 劉秉鑫
05/09 Lab Meeting-小嬿
Progress report:
1. 欲確定在293TetLuc細胞中, Dox treatment 3-9hrs之間, CTCF結合在c-Myc/H19 promoter的pattern. 初步CTCF-ChIP assay結果顯示在兩個promoter上, CTCF的結合量未有明顯的改變. 之後將進行293TetER細胞的CTCF-ChIP assay.
2. 分析目前已知Rta會結合的promoters, 利用軟體預測Rta responsive element(RRE)/CTCF binding site(CBS)/sp1 binding site. 目前觀察到的情形如下:
a) CTCF 與Rta結合位置重疊: BALF2, SFN
b) CTCF 與Sp1結合位置重疊: p21, SFN
c) CTCF/Rta/Sp1結合位置是鄰居: BLLF3, BHRF1/BHLF1
分析結果未整理完全, 待續
3. 利用direct infection的方式建立攜帶螢光的293LucEV/293EREV. 所篩到的clone能被Dox induction出來的viral particles比EREV8少了至少10倍. 之後提高G418濃度也未能讓viral particles被release更多, 因此先停住這個實驗.
1. 欲確定在293TetLuc細胞中, Dox treatment 3-9hrs之間, CTCF結合在c-Myc/H19 promoter的pattern. 初步CTCF-ChIP assay結果顯示在兩個promoter上, CTCF的結合量未有明顯的改變. 之後將進行293TetER細胞的CTCF-ChIP assay.
2. 分析目前已知Rta會結合的promoters, 利用軟體預測Rta responsive element(RRE)/CTCF binding site(CBS)/sp1 binding site. 目前觀察到的情形如下:
a) CTCF 與Rta結合位置重疊: BALF2, SFN
b) CTCF 與Sp1結合位置重疊: p21, SFN
c) CTCF/Rta/Sp1結合位置是鄰居: BLLF3, BHRF1/BHLF1
分析結果未整理完全, 待續
3. 利用direct infection的方式建立攜帶螢光的293LucEV/293EREV. 所篩到的clone能被Dox induction出來的viral particles比EREV8少了至少10倍. 之後提高G418濃度也未能讓viral particles被release更多, 因此先停住這個實驗.
May 4, 2012
5/2 Lab Meeting-ingrid
1.製備以下表現質體以供濁水溪公司代製兔子多株抗體
(1) pGEXHis_cZ :已分裝保存於-80℃冰箱。可用於WB(1:2000)(萍)、IFA(1:2000)(鏸)及免疫組織染色 (1:1000)(鏸)。
(2) pGEXHis_ER_Q320stop and pGEXHis_ER_L550stop : Q320stop已送給濁水溪代製。另外構築pGEXHis_ER_277E-516V做蛋白質表達。
(3) pGEXHis_KR_E600stop and pGEXHis_KR_Q658stop :蛋白質表現量太少(失敗)。
(4) pGEXHis_BALF3 :蛋白質表現量太少(失敗)。
2.使用EGFP當目標基因來測試建立NP460TetR_ER inducible cell lines的條件：用未稀釋的lentivirus病毒液直接感染6小時後移除，細胞發綠光比例接近100%，之後細胞放大後，使用10 ug/ml zeocin作篩選16天，發現未加Dox與有加Dox的綠光比例類似，建議做WB(flag)作確認。
3.萍使用Mini-PROTEAN II multiscreen apparatus (Bio-rad)來進行抗體最佳稀釋倍數的實驗。相關資料在https://www.bio-rad.com/prd/en/US/LSR/PDP/f9ec3085-b590-44c6-9b36-b36876cad466/Mini-PROTEAN_II_Multiscreen_Apparatus
首先置備只有一個well的膠體，樣品量為單一well*20=200ug (萍通常使用量)，轉漬完的NC膜置於裝置內，略將裝置傾斜後，從下面的孔注入600ul抗體稀釋液(避免氣泡)，室溫靜置2小時後，以Tip移除抗體稀釋液，用TBST清洗3次後，將裝置打開把NC膜拿出，進行後續二抗的雜交實驗。
(1) pGEXHis_cZ :已分裝保存於-80℃冰箱。可用於WB(1:2000)(萍)、IFA(1:2000)(鏸)及免疫組織染色 (1:1000)(鏸)。
(2) pGEXHis_ER_Q320stop and pGEXHis_ER_L550stop : Q320stop已送給濁水溪代製。另外構築pGEXHis_ER_277E-516V做蛋白質表達。
(3) pGEXHis_KR_E600stop and pGEXHis_KR_Q658stop :蛋白質表現量太少(失敗)。
(4) pGEXHis_BALF3 :蛋白質表現量太少(失敗)。
2.使用EGFP當目標基因來測試建立NP460TetR_ER inducible cell lines的條件：用未稀釋的lentivirus病毒液直接感染6小時後移除，細胞發綠光比例接近100%，之後細胞放大後，使用10 ug/ml zeocin作篩選16天，發現未加Dox與有加Dox的綠光比例類似，建議做WB(flag)作確認。
3.萍使用Mini-PROTEAN II multiscreen apparatus (Bio-rad)來進行抗體最佳稀釋倍數的實驗。相關資料在https://www.bio-rad.com/prd/en/US/LSR/PDP/f9ec3085-b590-44c6-9b36-b36876cad466/Mini-PROTEAN_II_Multiscreen_Apparatus
首先置備只有一個well的膠體，樣品量為單一well*20=200ug (萍通常使用量)，轉漬完的NC膜置於裝置內，略將裝置傾斜後，從下面的孔注入600ul抗體稀釋液(避免氣泡)，室溫靜置2小時後，以Tip移除抗體稀釋液，用TBST清洗3次後，將裝置打開把NC膜拿出，進行後續二抗的雜交實驗。
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