Sep 11, 2009
Aug 28, 2009
所謂的p-Value...
我們一般用的是Student's test. Wiki的介紹在這裡.
用途是在檢定兩組數據間相同的可能性,機率(p)小於o.o5表示這兩組其實是有差別的。 對想看差異性的人、p越小越有意思。
檢定的方式有三種:
(1)若兩組數據sample數相同, 則用成偶檢定 (paired t-test).
(2)若兩組數據sample數不同,但變異數相同,則做一般檢定 (t-test).(例如都是針對有無KR,實驗組有8個檢體,而對照組卻只做了5個). 在excel中,paired t-test參數是1, t-test參數是2. 因為2的條件較寬鬆,所以通常2做出來的p值較小(=相同的可能性較低=很合理嘛,因為兩組連sample數目都不同).
(3)若兩組數據sample數及變異數都不相同,則將參數設為3來作檢定.用今天最夯的話題來作比喻:有兩組人分別位於一條海峽的兩邊,同樣是用excel中TTEST做雙尾,3的測試.如果我們檢定兩組人對黃金的喜好, p值會接近1,看不出這兩組人有什麼分別;但是如果對達賴喇嘛四個字當議題做檢定,那p值會立刻變小,兩組人的差異會顯現出來.
總之,我們的實驗多是在相同條件下操作,應視為變異數相同,所以平常用1或2即可.生統學家則相反,因為他們的sample數目及屬性均超越時空,因此要選3才能見端倪.
用途是在檢定兩組數據間相同的可能性,機率(p)小於o.o5表示這兩組其實是有差別的。 對想看差異性的人、p越小越有意思。
檢定的方式有三種:
(1)若兩組數據sample數相同, 則用成偶檢定 (paired t-test).
(2)若兩組數據sample數不同,但變異數相同,則做一般檢定 (t-test).(例如都是針對有無KR,實驗組有8個檢體,而對照組卻只做了5個). 在excel中,paired t-test參數是1, t-test參數是2. 因為2的條件較寬鬆,所以通常2做出來的p值較小(=相同的可能性較低=很合理嘛,因為兩組連sample數目都不同).
(3)若兩組數據sample數及變異數都不相同,則將參數設為3來作檢定.用今天最夯的話題來作比喻:有兩組人分別位於一條海峽的兩邊,同樣是用excel中TTEST做雙尾,3的測試.如果我們檢定兩組人對黃金的喜好, p值會接近1,看不出這兩組人有什麼分別;但是如果對達賴喇嘛四個字當議題做檢定,那p值會立刻變小,兩組人的差異會顯現出來.
總之,我們的實驗多是在相同條件下操作,應視為變異數相同,所以平常用1或2即可.生統學家則相反,因為他們的sample數目及屬性均超越時空,因此要選3才能見端倪.
Aug 21, 2009
清理完冰箱後...
首先要謝謝大家的通力合作,希望丟掉/收納一些東西後,大家的手氣會更順!
下週我會把新的list一一印出來,例如protein marker/DNA marker現在都只留一兩根在門上,其餘都已放進新的盒子中.在這段過度時間中,若有東西找不到,請不吝在版上留言.有任何建議或不暸解處,也請提出來討論.另外每天最後離開的人,請幫忙確定一下兩個-20是否都已上鎖!謝謝.
下週我會把新的list一一印出來,例如protein marker/DNA marker現在都只留一兩根在門上,其餘都已放進新的盒子中.在這段過度時間中,若有東西找不到,請不吝在版上留言.有任何建議或不暸解處,也請提出來討論.另外每天最後離開的人,請幫忙確定一下兩個-20是否都已上鎖!謝謝.
Aug 15, 2009
0815新聞
這個基因好帥~(新聞在此~請按我)
基因突變 3%人只需日睡6小時
〔編譯張沛元／綜合報導〕美國科學家發現一種突變基因，使人每天晚上只需要睡6小時，依然能獲得充分休息並維持身體健康。不過，僅有3%的人類身上帶有這種突變基因，意味大多數人還是需要睡至少6小時以上。此一發現14日刊載於「科學」期刊。
日夜節律是掌管人類睡眠、飢餓與活動的一種生化循環。研究日夜節律的加州大學專家，發現一對母女每晚睡眠時間都不超過6.5小時；若晚上10點睡覺，69歲的母親隔天清晨4點起床，44歲的女兒則是4點半起床。
DEC2基因突變 不需睡滿8.5小時
驗血發現，這對母女掌管細胞製造與日夜節律的DEC2基因出現突變，似乎導致她們不需要像大多數人一樣，必須睡滿8.5小時才能獲得充分休息。
研究負責人、加州大學舊金山分校的神經學教授傅英惠（譯音）說，這名母親目前年逾70，經常出國旅行，每週有3到4個晚上會去跳舞。
傅英惠團隊研判，帶有這種突變基因者的睡眠比較深沉，所以不需睡太多。傅英惠估計，全人類中可能僅3%帶有這種突變基因，因此大多數睡眠時間少於8小時的人，形同累積對身體健康不利的因子；她正在研究是否能利用藥物來複製這種突變基因的效果，但該研究目前僅處於初步階段。
基因突變 3%人只需日睡6小時
〔編譯張沛元／綜合報導〕美國科學家發現一種突變基因，使人每天晚上只需要睡6小時，依然能獲得充分休息並維持身體健康。不過，僅有3%的人類身上帶有這種突變基因，意味大多數人還是需要睡至少6小時以上。此一發現14日刊載於「科學」期刊。
日夜節律是掌管人類睡眠、飢餓與活動的一種生化循環。研究日夜節律的加州大學專家，發現一對母女每晚睡眠時間都不超過6.5小時；若晚上10點睡覺，69歲的母親隔天清晨4點起床，44歲的女兒則是4點半起床。
DEC2基因突變 不需睡滿8.5小時
驗血發現，這對母女掌管細胞製造與日夜節律的DEC2基因出現突變，似乎導致她們不需要像大多數人一樣，必須睡滿8.5小時才能獲得充分休息。
研究負責人、加州大學舊金山分校的神經學教授傅英惠（譯音）說，這名母親目前年逾70，經常出國旅行，每週有3到4個晚上會去跳舞。
傅英惠團隊研判，帶有這種突變基因者的睡眠比較深沉，所以不需睡太多。傅英惠估計，全人類中可能僅3%帶有這種突變基因，因此大多數睡眠時間少於8小時的人，形同累積對身體健康不利的因子；她正在研究是否能利用藥物來複製這種突變基因的效果，但該研究目前僅處於初步階段。
Aug 9, 2009
Aug 7, 2009
KSHV-2009 Annual Meeting
2009/08/07_KSHV 2009
我們以後出國參加會議,尤其是歐美地區,所有步驟都要提早.才不會像這次一樣,慌慌張張地,處處都驚覺怎麼老是晚別人一部搶到好康的..目前SOP暫擬如下,請大家看看可行嗎?
1)abstract在deadline前一週寫好,24~72小時前寄出.
2)abstract deadline開始十天內是用來報名,詢問機票,旅館,籌劃旅程用的.
3)出發日前六週填寫電子表單,以利行前取得補助款項 (ps.先付的註冊費用,應由老闆代墊).
4)出發日前兩週完成Poster及Oral講稿,前一週完成rehersal（莫大的榮耀啊,恭喜小丸子...）
5)出發日前三天:睡飽、寫完實驗記錄、培養輕鬆愉悅心情、期待學習之旅!
08/05/09 SFL wrote:
旅館search result : 連結於此 (有眉目了呦,這次一定要把握, 大會秘書Leslie回信告知group rate確定已用完). 小丸子、Natsumi san我們今天來填電子表單怎麼樣?（十點左右我會下去先把旅館訂了,接著就來填表!）
(ps有試著找尋下半年度在日本或香港適合各位的會議,結果=0 (殘念).
7/19/09 SFL wrote:
將於九月十三~十六日在美國Charleston, South Carolina舉行.官方網站在這裡. 小嬿及小丸子可考慮競爭這個fellowship(註冊費475美金可waive掉). Due date for abstract submission is June-14.
KSHV 2009
我們以後出國參加會議,尤其是歐美地區,所有步驟都要提早.才不會像這次一樣,慌慌張張地,處處都驚覺怎麼老是晚別人一部搶到好康的..目前SOP暫擬如下,請大家看看可行嗎?
1)abstract在deadline前一週寫好,24~72小時前寄出.
2)abstract deadline開始十天內是用來報名,詢問機票,旅館,籌劃旅程用的.
3)出發日前六週填寫電子表單,以利行前取得補助款項 (ps.先付的註冊費用,應由老闆代墊).
4)出發日前兩週完成Poster及Oral講稿,前一週完成rehersal（莫大的榮耀啊,恭喜小丸子...）
5)出發日前三天:睡飽、寫完實驗記錄、培養輕鬆愉悅心情、期待學習之旅!
08/05/09 SFL wrote:
旅館search result : 連結於此 (有眉目了呦,這次一定要把握, 大會秘書Leslie回信告知group rate確定已用完). 小丸子、Natsumi san我們今天來填電子表單怎麼樣?（十點左右我會下去先把旅館訂了,接著就來填表!）
(ps有試著找尋下半年度在日本或香港適合各位的會議,結果=0 (殘念).
7/19/09 SFL wrote:
將於九月十三~十六日在美國Charleston, South Carolina舉行.官方網站在這裡. 小嬿及小丸子可考慮競爭這個fellowship(註冊費475美金可waive掉). Due date for abstract submission is June-14.
1)abstract在deadline前一週寫好,24~72小時前寄出.
2)abstract deadline開始十天內是用來報名,詢問機票,旅館,籌劃旅程用的.
3)出發日前六週填寫電子表單,以利行前取得補助款項 (ps.先付的註冊費用,應由老闆代墊).
4)出發日前兩週完成Poster及Oral講稿,前一週完成rehersal（莫大的榮耀啊,恭喜小丸子...）
5)出發日前三天:睡飽、寫完實驗記錄、培養輕鬆愉悅心情、期待學習之旅!
08/05/09 SFL wrote:
旅館search result : 連結於此 (有眉目了呦,這次一定要把握, 大會秘書Leslie回信告知group rate確定已用完). 小丸子、Natsumi san我們今天來填電子表單怎麼樣?（十點左右我會下去先把旅館訂了,接著就來填表!）
(ps有試著找尋下半年度在日本或香港適合各位的會議,結果=0 (殘念).
7/19/09 SFL wrote:
將於九月十三~十六日在美國Charleston, South Carolina舉行.官方網站在這裡. 小嬿及小丸子可考慮競爭這個fellowship(註冊費475美金可waive掉). Due date for abstract submission is June-14.
Aug 5, 2009
Maxi-Prep Log
應是去年10月就該PO的-大力感謝小丸子及小嬿 ! (謝對人了嗎?)
10/23/2008: (1)pEF1-RL, (2)pLenti-Flag-ERTA, (3)phRL-TK, (4) S634A/S636A
10/29/2008: (1)pRp#5, (2) pLenti-Flag-KRTA
11/21/2008: (1)pGL3-KRtapl, (2) pLenti4-Flag-CPO
BHLF1-Luc (waiting..)
10/23/2008: (1)pEF1-RL, (2)pLenti-Flag-ERTA, (3)phRL-TK, (4) S634A/S636A
10/29/2008: (1)pRp#5, (2) pLenti-Flag-KRTA
11/21/2008: (1)pGL3-KRtapl, (2) pLenti4-Flag-CPO
BHLF1-Luc (waiting..)
Jul 10, 2009
想要少病長壽?請減食
Jun 22, 2009
每天開工前請務必確認是否有已有AB number!
來問問大家的意見→為什麼不愛取AB number?
這包括下列兩種情形:(A)有在寫實驗記錄,但累積至一定量才要去登錄;(B)只靠腦袋在記,並沒有在寫記錄。這是我們Lab必守規矩之一(正在操作中的實驗一定要有一個AB#),希望大家都能共襄盛舉!
每天不把目標確定好,就奮力地往前衝,形同沒有行程、沒有目的地的旅行,出差錯、顧此失彼、原地繞圈子的機率非常高。另外,好的遊記一定來自每分每秒的悸動與想法,要等都玩回來了才逐步去描述,許多感覺早已失真了。作為科學家,頭腦清楚,認真誠實地做記錄、寫報告是我們的本份。能把這項份內工作培養成興趣/習慣會更好。勉勵大家要盡忠職守,把實驗室LogBook當作是我們整體的成長寫真集,不要馬虎掉取AB#這個重要步驟。
這包括下列兩種情形:(A)有在寫實驗記錄,但累積至一定量才要去登錄;(B)只靠腦袋在記,並沒有在寫記錄。這是我們Lab必守規矩之一(正在操作中的實驗一定要有一個AB#),希望大家都能共襄盛舉!
每天不把目標確定好,就奮力地往前衝,形同沒有行程、沒有目的地的旅行,出差錯、顧此失彼、原地繞圈子的機率非常高。另外,好的遊記一定來自每分每秒的悸動與想法,要等都玩回來了才逐步去描述,許多感覺早已失真了。作為科學家,頭腦清楚,認真誠實地做記錄、寫報告是我們的本份。能把這項份內工作培養成興趣/習慣會更好。勉勵大家要盡忠職守,把實驗室LogBook當作是我們整體的成長寫真集,不要馬虎掉取AB#這個重要步驟。
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