10/02 Journal Club Paper

Dear all:

附檔是我下禮拜要報告的paper，題目是: Transforming Fusions of FGFR and TACC Genes in Human Glioblastoma。

請大家多多指教了，謝謝各位。

0919 Lab Meeting-YJC

Progress Report

1. 欲觀察CTCF是否在EBV/KSHV的潛伏期中扮演repressor的角色:
a) 利用shRNA-lentivirus infection方式knockdown CTCF expression五天之後, 發現病毒RNA/protein表現量上升, 存在於細胞中及release到上清液的的病毒DNA copies也變多.
 --> shCTCF clone B情況較特殊, 將mix其他三個clone的病毒液再觀察一次結果
 --> viral transcripts/protein可多看BMRF1, K-bZIP
b) 將CTCF表現質體送入細胞中表現3天, 發現病毒RNA/protein表現量沒有變化, 存在於細胞中及release到上清液的病毒DNA copies變化也不大
 --> 調整細胞濃度做DNA transfection再觀察一次

2. 利用ChIP方式觀察EBV Rta表現是否影響CTCF結合於病毒基因體的能力. 初步結果可觀察到Dox-48hr細胞中, CTCF binding量比non-induction少; 而Rta除了binding在已知的RRE之外, 在目前所偵測的DNA片段上也都有Rta的訊號.
 --> EREV8的ChIP訊號都比ERKV弱, 需要多加確認
 --> ChIP所得DNA量太少, 將做些調整以提高所得DNA濃度

Dear all

附檔是我9/18想要報告的paper

請大家過目

謝謝


DATO

08/15 Ingrid報告

分析akata EGFP-EBV感染NP460hTert之後會發生什麼事 :
1.調整很多條件使感染率提高。
2.Rta及下游基因，以及Zta RNA皆在病毒感染後的細胞有偵測到。
3.但是用WB及IFA仍無法偵測到病毒蛋白質的表現，目前仍在確認中。

07/18 小丸報告

1.為了補強DDR1 paper的圖表，重新做了shAXL, shDDR1, shEGFR, shFGFR3的實驗，發現它們對OSCC細胞的生長抑制作用(WST-1 assay)有程度上的差異，其中DDR1在48h對細胞的抑制平均而言可達三成左右。
2.取OEC-M1為cell model，證實Glivec可以降低DDR1 auto-phosphorylation之程度。
3.Collagen type IV處理的HOK及TW2.6細胞中，可見及DDR1表現量增加，其餘細胞的相關實驗則由小夏幫忙檢測中。

New Jounal Club Schedule

放暑假了! 萬歲~~
這是下學期的schedule, 請參卓。

20120717 Journal club paper

Dear All

連結是我下周journal club想報告的paper

https://docs.google.com/file/d/0BxXkXLG0DRUATG1SQjY0T3U5SVE/edit

請大家過目

謝謝

06/20 Lab Meeting

泰利颱風來襲， Lab Meeting 暫停一次。

Male tea drinkers 'at greater risk of prostate cancer'

Dear all:
     今天晚上剛好看到的BBC NEWS，繼六杯咖啡長壽之後，每天七杯茶會讓男性攝護腺癌機率上升（抖），paper是發在 journal Nutrition and Cancer上的，有找到原文我再貼來。WTF...不能淡定的喝茶了=.=~
                                                                                                                                                             Can
                                                                                                                                                              

20120619 journal club paper

20120619 journal club paper
請按這裡下載
簡報檔: ppt檔
補充資料: Phase II的論文
1. oral premalignant lesions口腔癌前病變的主要處理方式是外科切除。
(參考資料:http://www.mmh.org.tw/taitam/onco_care/cancer_breast.asp?Ckinds_id=17)
所以表格2中，病史中有先前經過外科切除的病人現在是復發。
2.一開始即進行biopsy(baseline)，口服不同濃度的GTE膠囊共12週後，再進行採樣。
Higher mean baseline stromal vascular endothelial growth factor (VEGF) correlated with a
clinical (P = 0.04) but not histologic response. (stromal VEGF似乎可以當作預後因子)
Stromal VEGF and cyclin D1 expression were downregulated in clinically
responsive GTE patients and upregulated in nonresponsive patients at 12 weeks (versus
at baseline).

06/13 小夏報告

Slides have been uploaded to NAS.

ago2 transport

Dear all:
  Here is a paper showing that importin 8 is required for cytoplasmic miRNA-guided gene silencing and affects nuclear localization of Ago proteins.
                                                                                                                                                               Can