Mar 23, 2011

03/16 Lab Meeting-小嬿

To test Magnetic ChIP method:
1. non-specific band was less than agarose method
2. By using standard end-point PCR analysis, RNA Pol II is able to bind promoters of GAPDH, H19, and SFN; CTCF can bind H19 promoter and weakly on SFN promoter.
3. The problem of sonication efficiency is not dissolved yet.

Mar 22, 2011

3/16 Lab Meeting-ingrid

(1) Dox誘導型細胞株的選殖
TW05TetLuc:#1-6測試中
TW05TetER:#2-18的WB有認到ER,重新做IFA以確認表現蛋白質的比例及強弱
TW05TetER/gZ:#1-33測試中
(2) 以SK-N-SH cell、HelaTet、TW03Tet及TW05Tet lysates做OGT Ab的western analysis,用黃老師家的goat二抗,沒有認到目標蛋白質,重買OGT Ab。
(3) 以shLuc、shMGEA5的lentivirus (稀釋倍數1/8) 送入ERKV (2.4x10^5/ml/well/12well) 中,24、48、72小時後,收lysates進行WB確認目標蛋白質的確有減少,B2效果比D2好。

Mar 10, 2011

0309 Lab meeting-蔡小丸

1. 共同表達K-RTA與Pin1後發現, 大量Pin1表達會造成 K-RTA降解
2. 初步結果顯示 K-RTA與 Pin1間有交互作用, 但需加入IgG控制組
3. 完成silence DDR1對於口腔癌細胞株生長之影響

Mar 7, 2011

03/02 Lab Meeting-小嬿

1. check Q-PCR primers: p21 and SFN-->Workable!
2. ChIP test :
a. antibodies: mouse IgG, CTCF and Flag antibody
b. primers: H19ICR, SFN, GAPDH(coding region)
c. results: (1) the problem of sonication is not dissolved
(2) condition of Q-PCR is not well, but standard end-point PCR is OK
(3) input is not equal. (one of them is disappeared, actually)
(4) the amount of DNA fragment bound by mouse IgG was similar to CTCF
d. Future work:
(1) to try magnetic system by using standard end-point PCR (IgG and CTCF)
(2) to test Q-PCR condition

Mar 2, 2011

03/02 Lab Meeting- 小夏

No SFN signal in TW01TetEREV#27 cells may be due to GFP antibody-blocking. (Sorry didn’t think of it, I’ll check the probability)

2/23 Lab Meeting-ingrid

報告進度
(1) TW05TetER:#1-18中,除了#1及#12以外,其餘在IFA中,為FLAG Ab陽性,重複做IFA(點片)以重複確認。
(2) 以SK-N-SH cell lysates做OGT Ab的western analysis,覺得沒有認到目標蛋白質,再以Hela cell lysates當positive control及黃老師家的goat二抗再確認。

Feb 18, 2011

2011/02/18 生物醫療性廢棄物專用垃圾桶統計需求調查

紀錄一下:
1. 放置實驗桌上的小型桶: (7個) 直徑12cm 高13cm圓桶;
2. 置於地上的小型桶: (1個) 直徑25cm 高30cm圓桶;
3. 置於地上的中型桶: (2個) 長40cm 寬27cm 高55cm 方桶。

LabLog ID若有更正..

請印出自己的pdf核對一下。我想應該有不少地方是打錯的。請於更正後再還給我來為各位修正! 謝謝大家~

Feb 17, 2011

02/16 Lab Meeting-小夏

1. To compare expression levels of various host proteins in TW01-EREV#27 with its parental cell TW01TetER#16.
2. Test p53 and CDK6 antibodies from ICON.

02/16 Lab meeting-蔡小丸

1. CDK9 Kinase assay結果顯示 CDK9會磷酸化K-RTA 而S634/S636是其中一個位點
2. 初步看出來 K-RTA會被anti phospho-Ser/Thr-Pro MPM2所認識 而與 Pin-1間的交互作用仍需進一步證明
3. 完成silence DDR1對於口腔癌細胞株生長的影響 (DOK, HSC-3, OEC-M1, SCC-15, TW2.6)

Feb 12, 2011

PLoS ONE 已被接受,恭喜小嬿!

下一步就是弄清楚Rta是怎麼樣一次動到這麼多基因。這一篇我們就可以有完全的主導權囉~ 萬歲!終於擺脫EV/KV互剋、Rta促進pRb degradation的糾纏...謝謝小嬿替Lab Set-Up許多相關的實驗步驟。也恭喜小嬿!!

Feb 1, 2011

春聯釋疑

...釋迦牟尼佛在《法華經》裡說:「是法住法位,世間相常住。」任何一個現象都有它的位置,範圍與特性,毫不混亂,世間相就是這個樣子,亦即在日常生活中,我們看到的所有一切現象是法,而法之中有全體的法與差別的法,但是差別的法並沒有離開全體的法;每一法各有各的範圍和特性,而一切法也都有其共同性,在統一的和諧中,不失個別的差異現象,即是法住法位。by 法鼓山聖嚴法師

希望我們抬頭望到這句偈子時,別忘了讓手中正在研究的題目、操作的實驗均能 法住法位、各安其所。心中的思想也是。並恭賀大家 平安順事 春風得意!